Cerkev sv. Petra in Pavla je v preteklosti veljala za eno najlepših baročnih cerkva v Sloveniji. Januarja 1945 so jo skoraj v celoti uničile zavezniške letalske bombe. Od cerkve je ostal le del prezbiterija. Ob svoji 75-letnici so minoriti obnovili prezbiterij, v katerem so naslednjih nekaj let imeli maše.
Zadnjih nekaj let obnavljajo glavno cerkveno ladjo, ki že dobiva podobo moderne cerkve. V prezbiteriju se na prvotnem mestu-na stebrih iz portugalskega marmorja-že nahajajo restavrirani spomeniki svetnikov in madone iz 13. stoletja, ki jih je restavriral ptujski akademski kipar Viktor Gojkovič. V eni izmed dveh stranskih kapel se nahaja križev pot piranske kiparke Mire Ličen-Krmpotič iz leta 1988.